夏威夷果基因奥秘揭开

2023-10-13 11:03:49 来源: 科技日报 作者: 王祝华 谢卓

科技日报记者 王祝华 实习生 谢卓

10月12日,记者从海南大学获悉,该校夏志强团队破译了澳洲坚果基因组并对其进行了注释,成果于近日发表在《热带作物》期刊上。

澳洲坚果别名夏威夷果、昆士兰果,是一种原产于澳大利亚的树生坚果,含70%以上脂肪、9%蛋白质,且含有人体必需的8种氨基酸,因其果仁口感香脆,富含多种不饱和脂肪酸,具有极高的营养和保健价值,是百姓年货清单里的“常客”。

夏志强团队通过对我国内最早具有自主知识产权的澳洲坚果新品种——“桂热1号”进行三代测序,构建出了染色体级别的澳洲坚果基因组(792Mb Contig N50 1.9Mb)。该团队还通过基因从头预测和同源蛋白比对,发现了37657个编码蛋白。研究人员将澳洲坚果与11个物种进行基因家族分析,使用单拷贝基因构建系统发育树发现,澳洲坚果大约在71百万年前与同科的蒂罗花发生分化,此外,澳洲坚果在41百万年前发生了一次WGD事件(基因组加倍事件)。该研究还鉴定出120个GELP(GDSL型脂酶)基因家族成员,并确定了它们在14条染色体上的位置。

据悉,此项研究成果为澳洲坚果基因组学研究和分子标记育种提供新的资源,并且给澳洲坚果将来的遗传和进化研究带来更多的机遇。澳洲坚果的基因组信息还有助于阐明山龙眼科物种的进化过程,并进一步了解山龙眼科物种的生理和形态多样性,揭示澳洲坚果在进化史上的重要作用。

责任编辑: 王倩