科技日报实习记者 代小佩
核酸检测是否还可以改进?自我检测新冠病毒是否可行?14日晚间,在一场科普讲座中,北京大学化学学院教授、北京未来基因诊断高精尖创新中心研究员黄岩谊介绍了新冠病毒检测技术应用的相关内容。
缩短检测时间,提高检测通量
黄岩谊表示,核酸检测的改进首先要体现在速度上。一个常规的核酸检测过程是这样的:
快速取样后把样品存到运送培养基里,当样品攒到一定数量后进行集中灭活,即把这一批样品置于56摄氏度的水浴箱进行时长为30分钟的灭活,使病毒失去感染能力。然后再花大概30-90分钟进行核酸提取,接下来的PCR(聚合酶链式)反应需要40-60分钟。“整个实验做下来大概需要小半天时间。”黄岩谊说。
那么,这个过程能不能加速?
黄岩谊称,检测单个样品的话,比较好实现加速。样品采集后可跳过一些步骤直接做检测,比如直接放到裂解液中,然后快速做核酸提取,甚至不做提取就可以进入快速的PCR反应,可能在30分钟左右拿到检测结果。“核酸检测本身是可以保证快速的,尤其是样品量少的时候。但样品多的时候,一批一批操作更有效率。”
央视新闻截图
根据美国科学家日前发表的一份综述,大部分检测方法都能在一两个小时内能完成检测。黄岩谊表示,为了减少操作上的技术壁垒和失误,可采用能在现场使用的小型仪器装置,缩短检测时间。
“除了缩短时间,对于大规模的检测,提高检测通量是非常重要的。”黄岩谊表示,“使用检测试剂时需要对样品一个一个测,核酸提取这项工作特别消耗体力且需要经验、技巧,最好交给不知疲倦、不容易犯错的机器操作。”
比如,罗氏公司做的巨无霸仪器Cobas8800,一天大概可以完成3000个核酸检测,几乎全自动,把样品放进去后就开始做。“除了快速之外,一个重要的好处是可以保证在世界上不同地点,大家取得的结果是基本可靠和稳定的。这样,在基础比较薄弱、积累不够雄厚的地方,一样可以实现高品质的大规模检测。”
唾液采样检测
或有助于自我检测和自我采样
随着疫情进展,越来越多的检测需求出现了,自我检测、自我采样是否可行?
在美国第一个获批的居家自助采样试剂盒产品是LabCorp公司的产品Pixel,它用棉签在两个鼻腔中抹一下,然后寄回到检测中心做大规模检测,这样就不需要做很复杂的采样。黄岩谊表示,目前还没有看到大规模的评价数据。
一个多月前,华西医院的科研人员提出了用唾液检测新冠病毒的可能性。美国耶鲁大学的科学家上月也发表了一篇论文,结果表明,唾液采样的稳定性相当不错。
黄岩谊介绍称,前几天,美国新泽西的新泽西州立罗格斯大学及其下属的检测机构在美获得批准,开始使用唾液采集的样品进行新冠病毒检测。
“他们采用了一个流水线式的大规模处理的自动化机器,可以每天检测1万份样本。唾液采样检测是非常令人鼓舞的新方法。”黄岩谊表示。
核酸检测敏感度高、特异性强
讲座中,黄岩谊抛出一个问题:做了检测,是否就能得到可靠结果?
“这需要非常认真地思考,因为没有一个方法是完美的。分子检测从来都不是完美的,这世界上没有完美的检测方法。要了解每一种检测方法的优势和缺点,以便更好地选择和判断。”黄岩谊称。
武汉市洪山区和平街欧洲花园社区居民接受新冠病毒核酸取样。楚天都市报记者 李辉 摄
他表示,首先,检测的时间点非常重要。“在发病前几天的样品中病毒核酸载量是不多的,咽拭子或者肺泡的灌洗液要比粪便检测容易一些;但粪便可能存在的时间长一些,后期更容易检测出来。抗体都是在发病后期才出来的,IgM抗体衰退比较快,IgG抗体衰退得慢,停留时间会长一些。所以选择什么样的检测方法,跟时间节点有极其重要的关联性,每一个方法有极限。”
对检测方法具体的评价指标包含两个方面,一个是敏感度。敏感度考虑的是:所有的阳性样本中到底检测出多少真阳性。敏感度怎么计算?很简单,分子是检测出的真阳性的人数,分母是真阳性和假阴性的人数和。比如,使用某种检测方法得到的结果中,有25个真阳性,10个假阴性,那么这种检测方法的敏感度约为71%。
在分析中,研究人员经常用“检出限”来表示检测方法的灵敏度。检出限就是在给定的置信度条件下,可以从被测样品中检测待测组分的最小浓度或者最小量。
“实际上,现在大量使用的RT-PCR(反转录-聚合酶链式)技术的检测限非常低,也就是说检测的敏感度非常高。”黄岩谊表示。
另一个是特异性,也就是阴性的样本中有多少个真阴性。“核酸检测中特异性取决于引物选择的位置、引物序列与目标核酸的匹配,要考察是否真的能检测出来。”黄岩谊称,“现在为止没有哪个抗体检测方法真的具备和常规核酸检测一样稳定和优秀的特异性。”